La primaria de la Ciudad de los Niños de Padre Cuellar AC es una escuela muy especial, donde niños de ocho a once años se dan la oportunidad de estudiar, aprender, y transformarse en adolescentes inteligentes y equilibrados. Desde la página web de la Ciudad de los Niños: "La primaria, incorporada a la SEP, se encuentra dentro de las instalaciones de la CN. Contamos con 11 maestras, dos de ellas en “Educación Especial” (debido a las necesidades de algunos niños, como dislexia, lento aprendizaje, etc.) un director, una coordinadora académica y un coordinador de disciplina. Además, varios salones tienen “enciclomedia” hay una ludotecas, una pequeña biblioteca, canchas deportivas y juegos mecánicos infantiles." Esta escuela tan fascinante crea un ambiente perfecto para la educación y el desarollo de los niños de esta casa de hogar.
